- Dendrogenomics is a new interdisciplinary approach to study genetic mechanisms of adaptation and individual tree response to biotic and abiotic stresses: Siberian larch and Siberian stone pine cases : доклад, тезисы доклада [доклад, тезисы доклада, статья из сборника материалов конференций]
2024
присутствует в РИНЦ (eLIBRARY.RU)
- Population genetic variation of microsatellite markers developed for Siberian fir (Abies sibirica Ledeb.) and European silver fir (Abies alba Mill.) using whole genome sequencing data : научное издание [статья из журнала]
2023, Plant Genetic Resources: Characterisation and Utilisation
присутствует в РИНЦ (eLIBRARY.RU), Ядро РИНЦ (eLIBRARY.RU)
- Genetic Structure and Geographical Differentiation of Siberian Larch (Larix sibirica Ledeb.) Populations Based on Genome Genotyping by Sequencing : научное издание [статья из журнала]
2023, Contemporary Problems of Ecology
присутствует в РИНЦ (eLIBRARY.RU), Ядро РИНЦ (eLIBRARY.RU)
- Study of the Genetic Adaptation Mechanisms of Siberian Larch (Larix sibirica Ledeb.) Regarding Climatic Stresses Based on Dendrogenomic Analysis : научное издание [статья из журнала]
2023, Forests
присутствует в РИНЦ (eLIBRARY.RU), Ядро РИНЦ (eLIBRARY.RU)
- Генетическая структура и географическая дифференциация популяций лиственницы сибирской (Larix sibirica Ledeb.) на основе генотипирования генома путем секвенирования : научное издание [статья из журнала]
2023, Сибирский экологический журнал
присутствует в РИНЦ (eLIBRARY.RU), Ядро РИНЦ (eLIBRARY.RU)
- Genetic Adaptation of Siberian Larch (Larix sibirica Ledeb.) to High Altitudes : научное издание [статья из журнала]
2023, International Journal of Molecular Sciences
присутствует в РИНЦ (eLIBRARY.RU), Ядро РИНЦ (eLIBRARY.RU)
- Генетическая адаптация популяций лиственницы сибирской (Larix sibirica Ledeb.) к гетерогенной среде : доклад, тезисы доклада [доклад, тезисы доклада, статья из сборника материалов конференций]
2023, Устойчивость растений и микроорганизмов к неблагоприятным факторам среды
присутствует в РИНЦ (eLIBRARY.RU)
- Изучение генетической адаптации в популяциях лиственницы сибирской (Larix sibirica Ledeb.) с использованием данных полногеномного генотипирования : доклад, тезисы доклада [доклад, тезисы доклада, статья из сборника материалов конференций]
2022, Генетические процессы в популяциях
присутствует в РИНЦ (eLIBRARY.RU)
- Annotation of Siberian Larch (Larix sibirica Ledeb.) Nuclear Genome—One of the Most Cold-Resistant Tree Species in the Only Deciduous GENUS in Pinaceae [статья из журнала]
2022, Plants
присутствует в Scopus
- ANNOTATION OF SIBERIAN LARCH REFERENCE GENOME, THE ONLY SEASONAL SENESCENCE GENUS IN PINACEAE : доклад, тезисы доклада [доклад, тезисы доклада, статья из сборника материалов конференций]
2022, Высокопроизводительное секвенирование в геномике (HSG-2022)
присутствует в РИНЦ (eLIBRARY.RU)
- De Novo Transcriptome Assembly and Annotation of a New Plant Pathogenic Corinectria sp. Strain in Siberia : научное издание [статья из журнала]
2022, Микология и фитопатология
присутствует в Scopus, РИНЦ (eLIBRARY.RU), Ядро РИНЦ (eLIBRARY.RU)
- Comparative genomics analysis of repetitive elements in ten gymnosperm species: “dark repeatome” and its abundance in conifer and gnetum species [статья из журнала]
Titievsky Avi, Putintseva Yuliya A., Taranenko Elizaveta A., Baskin Sofya, Oreshkova Natalia V., Brodsky Elia, Sharova Alexandra V., Sharov Vadim V., Panov Julia, Kuzmin Dmitry A., Brodsky Leonid, Krutovsky Konstantin V. 2021, Life
присутствует в Web of Science Core Collection, Scopus, РИНЦ (eLIBRARY.RU), Ядро РИНЦ (eLIBRARY.RU)
- Annotation of Siberian larch genome draft assembly : доклад, тезисы доклада [доклад, тезисы доклада, статья из сборника материалов конференций]
2021, Plant Genetics, Genomics, Bioinformatics, and Biotechnology
присутствует в РИНЦ (eLIBRARY.RU)
- Repetitive elements in the genome of Siberian larch (Larix sibirica Ledeb.) : доклад, тезисы доклада [доклад, тезисы доклада, статья из сборника материалов конференций]
2020, BIOINFORMATICS OF GENOME REGULATION AND STRUCTURE/SYSTEMS BIOLOGY (BGRS/SB-2020)
присутствует в РИНЦ (eLIBRARY.RU)
- Genome-wide prediction of transcription start site in four conifer species : доклад, тезисы доклада [доклад, тезисы доклада, статья из сборника материалов конференций]
2020, BIOINFORMATICS OF GENOME REGULATION AND STRUCTURE/SYSTEMS BIOLOGY (BGRS/SB-2020)
присутствует в РИНЦ (eLIBRARY.RU)
- Siberian larch (Larix sibirica Ledeb.) mitochondrial genome assembled using both short and long nucleotide sequence reads is currently the largest known mitogenome : научное издание [статья из журнала]
Putintseva Yuliya A., Bondar Eugeniya I., Simonov Evgeniy P., Sharov Vadim V., Oreshkova Natalya V., Kuzmin Dmitry A., Konstantinov Yuri M., Shmakov Vladimir N., Belkov Vadim I., Sadovsky Michael G., Keech Olivier, Krutovsky Konstantin V. 2020, BMC GENOMICS
присутствует в Web of Science Core Collection, Scopus, РИНЦ (eLIBRARY.RU), Ядро РИНЦ (eLIBRARY.RU)
- De novo sequencing, assembly and functional annotation of Armillaria borealis genome [статья из журнала]
2020, BMC genomics
присутствует в Web of Science Core Collection, Scopus, РИНЦ (eLIBRARY.RU), Ядро РИНЦ (eLIBRARY.RU)
- De novo transcriptome assembly of cold stressed clones of the hexaploid Sequoia sempervirens (D. Don) Endl.
2020, Scientific Data
присутствует в Web of Science Core Collection, Scopus
- Assembling of the Siberian larch mitochondrial genome using long nucleotide sequence reads, the largest currently known mitogenome : доклад, тезисы доклада [доклад, тезисы доклада, статья из сборника материалов конференций]
2019, Plant Genetics, Genomics, Bioinformatics, and Biotechnology (PlantGen2019)
присутствует в РИНЦ (eLIBRARY.RU)
- Моделирование работы NGS секвенатора для сравнения ассемблеров [доклад, тезисы доклада, статья из сборника материалов конференций]
Кобец В. А., Ходос Г. А., Шаров В. В., Кузьмин Д. А. (научный руководитель), Садовский М. Г. (научный руководитель) 2019, МНСК-2019: БИОЛОГИЯ
присутствует в РИНЦ (eLIBRARY.RU)
- Постгеномные технологии в практическом лесном хозяйстве: разработка полногеномных маркеров для идентификации происхождения древесины и других задач [статья из журнала]
2019, Лесотехнический журнал
присутствует в РИНЦ (eLIBRARY.RU), Список ВАК
- Development of Nuclear Microsatellite Markers with Long (Tri-, Tetra-, Penta-, and Hexanucleotide) Motifs for Three Larch Species Based on the de novo Whole Genome Sequencing of Siberian Larch (Larix sibirica Ledeb.) [статья из журнала]
2019, RUSSIAN JOURNAL OF GENETICS
присутствует в Web of Science Core Collection, Scopus, РИНЦ (eLIBRARY.RU), Ядро РИНЦ (eLIBRARY.RU)
- Reads in NGS Are Distributed over a Sequence Very Inhomogeneously [доклад, тезисы доклада, статья из сборника материалов конференций]
2019, Lecture Notes in Computer Science (including subseries Lecture Notes in Artificial Intelligence and Lecture Notes in Bioinformatics)
присутствует в Scopus, РИНЦ (eLIBRARY.RU), Ядро РИНЦ (eLIBRARY.RU)
- Mobile genetic elements explain size variation in the mitochondrial genomes of four closely-related Armillaria species [статья из журнала]
2019, BMC Genomics
присутствует в Web of Science Core Collection, Scopus, РИНЦ (eLIBRARY.RU), Ядро РИНЦ (eLIBRARY.RU)
- Разработка ядерных микросателлитных маркеров с длинными (трех-, четырех-, пяти- и шестинуклеотидными) мотивами для трех видов лиственницы на основе полногеномного de novo секвенирования лиственницы сибирской (Larix sibirica Ledeb.) : научное издание [статья из журнала]
2019, Генетика
присутствует в РИНЦ (eLIBRARY.RU), Ядро РИНЦ (eLIBRARY.RU), Список ВАК
- Stepwise large genome assembly approach: a case of Siberian larch (Larix sibirica Ledeb) : материалы временных коллективов [доклад, тезисы доклада, статья из сборника материалов конференций]
2019, BMC BIOINFORMATICS
присутствует в Web of Science Core Collection, Scopus, РИНЦ (eLIBRARY.RU), Ядро РИНЦ (eLIBRARY.RU)
- Программа фильтрации избыточных последовательностей геномов в формате FASTA : регистрация программы для ЭВМ [патент]
2018
присутствует в РИНЦ (eLIBRARY.RU)
- Программный комплекс мониторинга изменений в файловой системе под управлением операционной системы Linux : регистрация программы для ЭВМ [патент]
2018
присутствует в РИНЦ (eLIBRARY.RU)
- Программный комплекс для объединения результатов поиска SNP в геномах : регистрация программы для ЭВМ [патент]
2018
присутствует в РИНЦ (eLIBRARY.RU)
- De novo sequencing, assembly and annotation of Armillaria borealis genome [доклад, тезисы доклада, статья из сборника материалов конференций]
2018, Integrative Bioinformatics and Systems Biology (WIBSB-2018)
присутствует в РИНЦ (eLIBRARY.RU)
- Sequencing and assembly of mitochondrial genomes in three conifer species Larix sibirica, Pinus sibirica and Pinus sylvestris [доклад, тезисы доклада, статья из сборника материалов конференций]
Bondar E., Kirichenko A., Sharov V., Putintseva Yu., Oreshkova N., Feranchuk S., Konstantinov Yu., Shmakov V., Belkov V., Kuzmin D., Sadovsky S., Krutovsky K. 2018, Bioinformatics of Genome Regulation and Structure\Systems Biology (BGRS\SB-2018)
присутствует в РИНЦ (eLIBRARY.RU)
- Genomes of three conifer species: Larix sibirica, Pinus sibirica and Pinus sylvestris [доклад, тезисы доклада, статья из сборника материалов конференций]
Putintseva Yu., Sharov V., Kuzmin D., Oreshkova N., Feranchuk S., Biryukov V., Novikova S., Miroshnikova K., Makolov S., Sadovsky M., Krutovsky K. 2018, Bioinformatics of Genome Regulation and Structure\Systems Biology (BGRS\SB-2018)
присутствует в РИНЦ (eLIBRARY.RU), Ядро РИНЦ (eLIBRARY.RU)
- Evolution of mitochondrial genomes in three closely-related Armillaria species [доклад, тезисы доклада, статья из сборника материалов конференций]
2018, Bioinformatics of Genome Regulation and Structure\Systems Biology (BGRS\SB-2018)
присутствует в РИНЦ (eLIBRARY.RU), Ядро РИНЦ (eLIBRARY.RU)
- Genome de novo sequencing, assembly and functional annotation of pathogenic fungi Armillaria borealis [доклад, тезисы доклада, статья из сборника материалов конференций]
2018, Bioinformatics of Genome Regulation and Structure\Systems Biology (BGRS\SB-2018)
присутствует в РИНЦ (eLIBRARY.RU), Ядро РИНЦ (eLIBRARY.RU)
- О ЗАДАЧЕ ИМИТАЦИОННОГО МОДЕЛИРОВАНИЯ РАБОТЫ СЕКВЕНАТОРА NGS : доклад, тезисы доклада [доклад, тезисы доклада, статья из сборника материалов конференций]
2018, Нейроинформатика, её приложения и анализ данных
присутствует в РИНЦ (eLIBRARY.RU)
- Сборка митохондриального генома сосны сибирской кедровой (Pinus sibirica Du Tour) : доклад, тезисы доклада [доклад, тезисы доклада, статья из сборника материалов конференций]
Кириченко А. Д., Бондар Е. И., Шаров В. В., Путинцева Ю. А. (научный руководитель), Крутовский К. В. (научный руководитель) 2018, МНСК-2018: Биология
присутствует в РИНЦ (eLIBRARY.RU)
- Комплекс предобработки ридов NGS : регистрация программы для ЭВМ [патент]
2017
присутствует в РИНЦ (eLIBRARY.RU)
- СБОРКА И АННОТИРОВАНИЕ ГЕНОМА ЛИСТВЕННИЦЫ СИБИРСКОЙ : доклад, тезисы доклада [доклад, тезисы доклада, статья из сборника материалов конференций]
2017, Высокопроизводительное секвенирование в геномике
присутствует в РИНЦ (eLIBRARY.RU)
- De novo assembling and primary analysis of genome and transcriptome of gray whale Eschrichtius robustus : научное издание [статья из журнала]
Moskalev A. A., Kudryavtseva A. V., Graphodatsky A. S., Beklemisheva V. R., Serdyukova N. A., Krutovsky K. V., Sharov V. V., Kulakovskiy I. V., Lando A. S., Kasianov A. S., Kuzmin D. A., Putintseva Y. A., Feranchuk S. I., Shaposhnikov M. V., Fraifeld V. E., Toren D., Snezhkina A. V., Sitnik V. V. 2017, BMC Evolutionary Biology
присутствует в Web of Science Core Collection, Scopus, РИНЦ (eLIBRARY.RU), Ядро РИНЦ (eLIBRARY.RU)
- РАЗРАБОТКА МИКРОСАТЕЛЛИТНЫХ МАРКЕРОВ ЛИСТВЕННИЦЫ СИБИРСКОЙ (Larix sibirica Ledeb.) НА ОСНОВЕ ПОЛНОГЕНОМНОГО de novo СЕКВЕНИРОВАНИЯ : научное издание [статья из журнала]
2017, Генетика
присутствует в РИНЦ (eLIBRARY.RU), Ядро РИНЦ (eLIBRARY.RU), Список ВАК
- Development of Microsatellite Genetic Markers in Siberian Larch (Larix sibirica Ledeb.) Based on the de novo Whole Genome Sequencing : научное издание [статья из журнала]
2017, RUSSIAN JOURNAL OF GENETICS
присутствует в Web of Science Core Collection, Scopus, РИНЦ (eLIBRARY.RU)
- ФУНКЦИОНАЛЬНАЯ АННОТАЦИЯ ГЕНОМА ЛИСТВЕННИЦЫ КАК ПОДХОД К ПРОЯСНЕНИЮ МЕХАНИЗМОВ ФОРМИРОВАНИЯ ВАЖНЫХ ГЕНЕТИЧЕСКИХ ПРИЗНАКОВ : доклад, тезисы доклада [доклад, тезисы доклада, статья из сборника материалов конференций]
2017, Сохранение лесных генетических ресурсов
присутствует в РИНЦ (eLIBRARY.RU)
- Программа для индексирования геномных последовательностей большого размера методом "FM-index" на графических ускорителях : регистрация программы для ЭВМ [патент]
2016
присутствует в РИНЦ (eLIBRARY.RU)
- STUDY OF ARMILLARIA BOREALIS PATHOGENICITY BY THE COMPARATIVE WHOLE GENOME SEQUENCING : доклад, тезисы доклада [доклад, тезисы доклада, статья из сборника материалов конференций]
2016, The tenth international conference on bioinformatics of genome regulation and structure\systems biology
присутствует в РИНЦ (eLIBRARY.RU)
- SEQUENCING OF CONIFER GENOMES USING NGS : доклад, тезисы доклада [доклад, тезисы доклада, статья из сборника материалов конференций]
2016, The tenth international conference on bioinformatics of genome regulation and structure\systems biology
присутствует в РИНЦ (eLIBRARY.RU)
- Разработка микросателлитных маркеров сосны кедровой сибирской (italicPinus sibirica/italic Du Tour) по результатам полногеномного italicde novo/italic секвенирования : научное издание [статья из журнала]
Белоконь М. М., Кузьмин Д. А., Крутовский К. В., Политов Д. В., Мудрик Е. А., Полякова Т. А., Шатохина А. В., Белоконь Ю. С., Орешкова Н. В., Путинцева Ю. А., Шаров В. В. 2016, Генетика
присутствует в РИНЦ (eLIBRARY.RU), Ядро РИНЦ (eLIBRARY.RU), Список ВАК
- ПАРАЛЛЕЛЬНЫЙ АЛГОРИТМ ФИЛЬТРАЦИИ ПОВТОРОВ В ДАННЫХ NGS ILLUMINA : научное издание [статья из журнала]
2016, Доклады Академии наук высшей школы Российской Федерации
присутствует в РИНЦ (eLIBRARY.RU), Список ВАК
- Development of Microsatellite Genetic Markers in Siberian Stone Pine (Pinus sibirica Du Tour) Based on the de novo Whole Genome Sequencing [статья из журнала]
Belokon M. M., Politov D. V., Mudrik E. A., Polyakova T. A., Shatokhina A. V., Belokon Yu. S., Oreshkova N. V., Putintseva Yu. A., Sharov V. V., Kuzmin D. A., Krutovsky K. V. 2016, RUSSIAN JOURNAL OF GENETICS
присутствует в Web of Science Core Collection, Scopus
- Секвенирование и сборка геномов лиственницы сибирской (Larix sibirica Ledeb.) и сосны сибирской кедровой (Pinus sibirica Du Tour) и предварительные данные анализа транскриптома : доклад, тезисы доклада [доклад, тезисы доклада, статья из сборника материалов конференций]
2015, Сохранение лесных генетических ресурсов Сибири
присутствует в РИНЦ (eLIBRARY.RU)
- Программный комплекс для определения размера библиотек (insert size) парных ридов NGS Illumina : регистрация программы для ЭВМ [патент]
2015
присутствует в РИНЦ (eLIBRARY.RU)
- Программный комплекс по подготовке ридов NGS Illumina к ассемблированию : регистрация программы для ЭВМ [патент]
2015
присутствует в РИНЦ (eLIBRARY.RU)
- CHALLENGES OF ASSEMBLING HUGE CONIFER GENOMES : доклад, тезисы доклада [доклад, тезисы доклада, статья из сборника материалов конференций]
2015, Plant Genetics, Genomics, Bioinformatics and Biotechnology
присутствует в РИНЦ (eLIBRARY.RU)
- THE WHOLE DE NOVO GENOME SEQUENCING AND ASSEMBLY OF SIBERIAN LARCH (LARIX SIBIRICA LEDEB.) AND SIBERIAN PINE (PINUS SIBIRICA DU TOUR.) : доклад, тезисы доклада [доклад, тезисы доклада, статья из сборника материалов конференций]
2015, Plant Genetics, Genomics, Bioinformatics and Biotechnology
присутствует в РИНЦ (eLIBRARY.RU)
- DE NOVO SEQUENCING OF CONIFER MEGAGENOMES : доклад, тезисы доклада [доклад, тезисы доклада, статья из сборника материалов конференций]
Krutovsky K. V., Oreshkova N. V., Putintseva Yu. A., Kuzmin D. A., Sharov V. V., Biryukov V. V., Makolov S. V., Deych K. O., Bondar E. I., Ushakova O. A., Ibe A. A., Shilkina E. A. 2015, Plant Genetics, Genomics, Bioinformatics and Biotechnology
присутствует в РИНЦ (eLIBRARY.RU)