1. Genetic Adaptation of Siberian Larch (Larix sibirica Ledeb.) to High Altitudes : научное издание [статья из журнала]
   Novikova Serafima V., Sharov Vadim V., Oreshkova Natalia V., Simonov Evgeniy P., Krutovsky Konstantin V.
   2023, International Journal of Molecular Sciences
   присутствует в РИНЦ (eLIBRARY.RU), Ядро РИНЦ (eLIBRARY.RU)
2. Генетическая адаптация популяций лиственницы сибирской (Larix sibirica Ledeb.) к гетерогенной среде : доклад, тезисы доклада [доклад, тезисы доклада, статья из сборника материалов конференций]
   Новикова С. В., Орешкова Н. В., Шаров В. В., Семериков В. Л., Крутовский К. В.
   2023, Устойчивость растений и микроорганизмов к неблагоприятным факторам среды
   присутствует в РИНЦ (eLIBRARY.RU)
3. Изучение генетической адаптации в популяциях лиственницы сибирской (Larix sibirica Ledeb.) с использованием данных полногеномного генотипирования : доклад, тезисы доклада [доклад, тезисы доклада, статья из сборника материалов конференций]
   Новикова С. В., Шаров В. В., Орешкова Н. В., Симонов Е. П., Крутовский К. В.
   2022, Генетические процессы в популяциях
   присутствует в РИНЦ (eLIBRARY.RU)
4. Annotation of Siberian Larch (Larix sibirica Ledeb.) Nuclear Genome—One of the Most Cold-Resistant Tree Species in the Only Deciduous GENUS in Pinaceae [статья из журнала]
   Bondar E. I., Feranchuk S. I., Miroshnikova K. A., Sharov V. V., Kuzmin D. A., Oreshkova N. V., Krutovsky K. V.
   2022, Plants
   присутствует в Scopus
5. ANNOTATION OF SIBERIAN LARCH REFERENCE GENOME, THE ONLY SEASONAL SENESCENCE GENUS IN PINACEAE : доклад, тезисы доклада [доклад, тезисы доклада, статья из сборника материалов конференций]
   Bondar E. I., Feranchuk S. I., Miroshnikova K. A., Sharov V. V., Kuzmin D. A., Oreshkova N. V., Krutovsky K. V.
   2022, Высокопроизводительное секвенирование в геномике (HSG-2022)
   присутствует в РИНЦ (eLIBRARY.RU)
6. De Novo Transcriptome Assembly and Annotation of a New Plant Pathogenic Corinectria sp. Strain in Siberia : научное издание [статья из журнала]
   Biriukov V. V., Pavlov I. N., Litovka Yu. A., Oreshkova N. V., Sharov V. V., Simonov E. P., Kuzmin D. A., Krutovsky K. V.
   2022, Микология и фитопатология
   присутствует в Scopus, РИНЦ (eLIBRARY.RU), Ядро РИНЦ (eLIBRARY.RU)
7. Comparative genomics analysis of repetitive elements in ten gymnosperm species: “dark repeatome” and its abundance in conifer and gnetum species [статья из журнала]
   Titievsky Avi, Putintseva Yuliya A., Taranenko Elizaveta A., Baskin Sofya, Oreshkova Natalia V., Brodsky Elia, Sharova Alexandra V., Sharov Vadim V., Panov Julia, Kuzmin Dmitry A., Brodsky Leonid, Krutovsky Konstantin V.
   2021, Life
   присутствует в Web of Science Core Collection, Scopus, РИНЦ (eLIBRARY.RU), Ядро РИНЦ (eLIBRARY.RU)
8. Annotation of Siberian larch genome draft assembly : доклад, тезисы доклада [доклад, тезисы доклада, статья из сборника материалов конференций]
   Bondar E. I., Feranchuk S. I., Birukhov V. V., Kuzmin D. A., Sharov V. V., Oreshkova N. V., Krutovsky K. V.
   2021, Plant Genetics, Genomics, Bioinformatics, and Biotechnology
   присутствует в РИНЦ (eLIBRARY.RU)
9. Repetitive elements in the genome of Siberian larch (Larix sibirica Ledeb.) : доклад, тезисы доклада [доклад, тезисы доклада, статья из сборника материалов конференций]
   Miroshnikova K. A., Biriukov V. V., Kuzmin D. A., Sadovsky M. G., Bondar E. I., Putintseva Y. A., Krutovsky Konstantin V., Akulova V. S., Sharov V. V., Oreshkova N. V.
   2020, BIOINFORMATICS OF GENOME REGULATION AND STRUCTURE/SYSTEMS BIOLOGY (BGRS/SB-2020)
   присутствует в РИНЦ (eLIBRARY.RU)
10. Genome-wide prediction of transcription start site in four conifer species : доклад, тезисы доклада [доклад, тезисы доклада, статья из сборника материалов конференций]
    Bondar Eugeniia I., Sharov Vadim V., Kuzmin Dmitry A., Tatarinova Tatiana V., Krutovsky Konstantin V.
    2020, BIOINFORMATICS OF GENOME REGULATION AND STRUCTURE/SYSTEMS BIOLOGY (BGRS/SB-2020)
    присутствует в РИНЦ (eLIBRARY.RU)
11. Siberian larch (Larix sibirica Ledeb.) mitochondrial genome assembled using both short and long nucleotide sequence reads is currently the largest known mitogenome : научное издание [статья из журнала]
    Putintseva Yuliya A., Bondar Eugeniya I., Simonov Evgeniy P., Sharov Vadim V., Oreshkova Natalya V., Kuzmin Dmitry A., Konstantinov Yuri M., Shmakov Vladimir N., Belkov Vadim I., Sadovsky Michael G., Keech Olivier, Krutovsky Konstantin V.
    2020, BMC GENOMICS
    присутствует в Web of Science Core Collection, Scopus, РИНЦ (eLIBRARY.RU), Ядро РИНЦ (eLIBRARY.RU)
12. De novo sequencing, assembly and functional annotation of Armillaria borealis genome [статья из журнала]
    Akulova Vasilina S., Sharov Vadim V., Aksyonova Anastasiya I., Putintseva Yuliya A., Oreshkova Natalya V., Feranchuk Sergey I., Kuzmin Dmitry A., Pavlov Igor N., Litovka Yulia A., Krutovsky Konstantin V.
    2020, BMC genomics
    присутствует в Web of Science Core Collection, Scopus, РИНЦ (eLIBRARY.RU), Ядро РИНЦ (eLIBRARY.RU)
13. De novo transcriptome assembly of cold stressed clones of the hexaploid Sequoia sempervirens (D. Don) Endl.
    Breidenbach Natalie, Sharov Vadim V., Gailing Oliver, Krutovsky Konstantin V.
    2020, Scientific Data
    присутствует в Web of Science Core Collection, Scopus
14. Assembling of the Siberian larch mitochondrial genome using long nucleotide sequence reads, the largest currently known mitogenome : доклад, тезисы доклада [доклад, тезисы доклада, статья из сборника материалов конференций]
    Putintseva Y. A., Bondar E. I., Sharov V. V., Simonov E. P., Oreshkova N. V., Kuzmin D. A., Sadovsky M. G., Krutovsky K. V.
    2019, Plant Genetics, Genomics, Bioinformatics, and Biotechnology (PlantGen2019)
    присутствует в РИНЦ (eLIBRARY.RU)
15. Моделирование работы NGS секвенатора для сравнения ассемблеров [доклад, тезисы доклада, статья из сборника материалов конференций]
    Кобец В. А., Ходос Г. А., Шаров В. В., Кузьмин Д. А. (научный руководитель), Садовский М. Г. (научный руководитель)
    2019, МНСК-2019: БИОЛОГИЯ
    присутствует в РИНЦ (eLIBRARY.RU)
16. Постгеномные технологии в практическом лесном хозяйстве: разработка полногеномных маркеров для идентификации происхождения древесины и других задач [статья из журнала]
    Крутовский Константин Валериевич, Путинцева Юлия Андреевна, Орешкова Наталья Викторовна, Бондар Евгения Ивановна, Шаров Вадим Витальевич, Кузмин Дмитрий Александрович
    2019, Лесотехнический журнал
    присутствует в РИНЦ (eLIBRARY.RU), Список ВАК
17. Development of Nuclear Microsatellite Markers with Long (Tri-, Tetra-, Penta-, and Hexanucleotide) Motifs for Three Larch Species Based on the de novo Whole Genome Sequencing of Siberian Larch (Larix sibirica Ledeb.) [статья из журнала]
    Oreshkova N. V., Bondar E. I., Putintseva Yu. A., Sharov V. V., Kuzmin D. A., Krutovsky K. V.
    2019, RUSSIAN JOURNAL OF GENETICS
    присутствует в Web of Science Core Collection, Scopus, РИНЦ (eLIBRARY.RU), Ядро РИНЦ (eLIBRARY.RU)
18. Reads in NGS Are Distributed over a Sequence Very Inhomogeneously [доклад, тезисы доклада, статья из сборника материалов конференций]
    Sadovsky M., Kobets V., Khodos G., Kuzmin D., Sharov V.
    2019, Lecture Notes in Computer Science (including subseries Lecture Notes in Artificial Intelligence and Lecture Notes in Bioinformatics)
    присутствует в Scopus, РИНЦ (eLIBRARY.RU), Ядро РИНЦ (eLIBRARY.RU)
19. Mobile genetic elements explain size variation in the mitochondrial genomes of four closely-related Armillaria species [статья из журнала]
    Kolesnikova Anna, Putintseva Yuliya A., Simonov Evgeniy P., Biriukov Vladislav V., Oreshkova Natalya, Pavlov Igor N., Sharov Vadim V., Kuzmin Dmitry A., Anderson James B., Krutovsky Konstantin
    2019, BMC Genomics
    присутствует в Web of Science Core Collection, Scopus, РИНЦ (eLIBRARY.RU), Ядро РИНЦ (eLIBRARY.RU)
20. Разработка ядерных микросателлитных маркеров с длинными (трех-, четырех-, пяти- и шестинуклеотидными) мотивами для трех видов лиственницы на основе полногеномного de novo секвенирования лиственницы сибирской (Larix sibirica Ledeb.) : научное издание [статья из журнала]
    Орешкова Н. В., Бондар Е. И., Путинцева Ю. А., Шаров В. В., Кузьмин Д. А., Крутовский К. В.
    2019, Генетика
    присутствует в РИНЦ (eLIBRARY.RU), Ядро РИНЦ (eLIBRARY.RU), Список ВАК
21. Stepwise large genome assembly approach: a case of Siberian larch (Larix sibirica Ledeb) : материалы временных коллективов [доклад, тезисы доклада, статья из сборника материалов конференций]
    Kuzmin Dmitry A., Feranchuk Sergey I., Sharov Vadim V., Cybin Alexander N., Makolov Stepan V., Putintseva Yuliya A., Oreshkova Natalya V., Krutovsky Konstantin V.
    2019, BMC BIOINFORMATICS
    присутствует в Web of Science Core Collection, Scopus, РИНЦ (eLIBRARY.RU), Ядро РИНЦ (eLIBRARY.RU)
22. Программа фильтрации избыточных последовательностей геномов в формате FASTA : регистрация программы для ЭВМ [патент]
    Шаров Вадим Витальевич, Кузьмин Дмитрий Александрович
    2018
    присутствует в РИНЦ (eLIBRARY.RU)
23. Программный комплекс мониторинга изменений в файловой системе под управлением операционной системы Linux : регистрация программы для ЭВМ [патент]
    Шаров Вадим Витальевич, Кузьмин Дмитрий Александрович
    2018
    присутствует в РИНЦ (eLIBRARY.RU)
24. Программный комплекс для объединения результатов поиска SNP в геномах : регистрация программы для ЭВМ [патент]
    Шаров Вадим Витальевич, Кузьмин Дмитрий Александрович
    2018
    присутствует в РИНЦ (eLIBRARY.RU)
25. De novo sequencing, assembly and annotation of Armillaria borealis genome [доклад, тезисы доклада, статья из сборника материалов конференций]
    Akulova V., Sharov V., Putintseva Yu., Oreshkova N., Feranchuk S., Kuzmin D., Pavlov I., Krutovsky K.
    2018, Integrative Bioinformatics and Systems Biology (WIBSB-2018)
    присутствует в РИНЦ (eLIBRARY.RU)
26. Sequencing and assembly of mitochondrial genomes in three conifer species Larix sibirica, Pinus sibirica and Pinus sylvestris [доклад, тезисы доклада, статья из сборника материалов конференций]
    Bondar E., Kirichenko A., Sharov V., Putintseva Yu., Oreshkova N., Feranchuk S., Konstantinov Yu., Shmakov V., Belkov V., Kuzmin D., Sadovsky S., Krutovsky K.
    2018, Bioinformatics of Genome Regulation and Structure\Systems Biology (BGRS\SB-2018)
    присутствует в РИНЦ (eLIBRARY.RU)
27. Genomes of three conifer species: Larix sibirica, Pinus sibirica and Pinus sylvestris [доклад, тезисы доклада, статья из сборника материалов конференций]
    Putintseva Yu., Sharov V., Kuzmin D., Oreshkova N., Feranchuk S., Biryukov V., Novikova S., Miroshnikova K., Makolov S., Sadovsky M., Krutovsky K.
    2018, Bioinformatics of Genome Regulation and Structure\Systems Biology (BGRS\SB-2018)
    присутствует в РИНЦ (eLIBRARY.RU), Ядро РИНЦ (eLIBRARY.RU)
28. Evolution of mitochondrial genomes in three closely-related Armillaria species [доклад, тезисы доклада, статья из сборника материалов конференций]
    Kolesnikova A., Putintseva Yu., Jain S., Oreshkova N., Pavlov I., Sharov V., Kuzmin D., Makolov S., Krutovsky K.
    2018, Bioinformatics of Genome Regulation and Structure\Systems Biology (BGRS\SB-2018)
    присутствует в РИНЦ (eLIBRARY.RU), Ядро РИНЦ (eLIBRARY.RU)
29. Genome de novo sequencing, assembly and functional annotation of pathogenic fungi Armillaria borealis [доклад, тезисы доклада, статья из сборника материалов конференций]
    Akulova V., Sharov V., Putintseva Yu., Oreshkova N., Feranchuk S., Kuzmin D., Pavlov I., Krutovsky K.
    2018, Bioinformatics of Genome Regulation and Structure\Systems Biology (BGRS\SB-2018)
    присутствует в РИНЦ (eLIBRARY.RU), Ядро РИНЦ (eLIBRARY.RU)
30. О ЗАДАЧЕ ИМИТАЦИОННОГО МОДЕЛИРОВАНИЯ РАБОТЫ СЕКВЕНАТОРА NGS : доклад, тезисы доклада [доклад, тезисы доклада, статья из сборника материалов конференций]
    Шаров В. В., Кобец В. А., Кузьмин Д. А., Ходос Г. А., Садовский М. Г.
    2018, Нейроинформатика, её приложения и анализ данных
    присутствует в РИНЦ (eLIBRARY.RU)
31. Сборка митохондриального генома сосны сибирской кедровой (Pinus sibirica Du Tour) : доклад, тезисы доклада [доклад, тезисы доклада, статья из сборника материалов конференций]
    Кириченко А. Д., Бондар Е. И., Шаров В. В., Путинцева Ю. А. (научный руководитель), Крутовский К. В. (научный руководитель)
    2018, МНСК-2018: Биология
    присутствует в РИНЦ (eLIBRARY.RU)
32. Комплекс предобработки ридов NGS : регистрация программы для ЭВМ [патент]
    Шаров Вадим Витальевич, Маколов Степан Викторович, Кузьмин Дмитрий Александрович
    2017
    присутствует в РИНЦ (eLIBRARY.RU)
33. СБОРКА И АННОТИРОВАНИЕ ГЕНОМА ЛИСТВЕННИЦЫ СИБИРСКОЙ : доклад, тезисы доклада [доклад, тезисы доклада, статья из сборника материалов конференций]
    Шаров В. В., Путинцева Ю. А., Кузьмин Д. А., Орешкова Н. В., Феранчук С. И., Цыбин А. Н., Маколов С. В., Крутовский К. В.
    2017, Высокопроизводительное секвенирование в геномике
    присутствует в РИНЦ (eLIBRARY.RU)
34. De novo assembling and primary analysis of genome and transcriptome of gray whale Eschrichtius robustus : научное издание [статья из журнала]
    Moskalev A. A., Kudryavtseva A. V., Graphodatsky A. S., Beklemisheva V. R., Serdyukova N. A., Krutovsky K. V., Sharov V. V., Kulakovskiy I. V., Lando A. S., Kasianov A. S., Kuzmin D. A., Putintseva Y. A., Feranchuk S. I., Shaposhnikov M. V., Fraifeld V. E., Toren D., Snezhkina A. V., Sitnik V. V.
    2017, BMC Evolutionary Biology
    присутствует в Web of Science Core Collection, Scopus, РИНЦ (eLIBRARY.RU), Ядро РИНЦ (eLIBRARY.RU)
35. РАЗРАБОТКА МИКРОСАТЕЛЛИТНЫХ МАРКЕРОВ ЛИСТВЕННИЦЫ СИБИРСКОЙ (Larix sibirica Ledeb.) НА ОСНОВЕ ПОЛНОГЕНОМНОГО de novo СЕКВЕНИРОВАНИЯ : научное издание [статья из журнала]
    Орешкова Н. В., Путинцева Ю. А., Шаров В. В., Кузьмин Д. А., Крутовский К. В.
    2017, Генетика
    присутствует в РИНЦ (eLIBRARY.RU), Ядро РИНЦ (eLIBRARY.RU), Список ВАК
36. Development of Microsatellite Genetic Markers in Siberian Larch (Larix sibirica Ledeb.) Based on the de novo Whole Genome Sequencing : научное издание [статья из журнала]
    Oreshkova N. V., Putintseva Yu. A., Sharov V. V., Kuzmin D. A., Krutovsky K. V.
    2017, RUSSIAN JOURNAL OF GENETICS
    присутствует в Web of Science Core Collection, Scopus, РИНЦ (eLIBRARY.RU)
37. ФУНКЦИОНАЛЬНАЯ АННОТАЦИЯ ГЕНОМА ЛИСТВЕННИЦЫ КАК ПОДХОД К ПРОЯСНЕНИЮ МЕХАНИЗМОВ ФОРМИРОВАНИЯ ВАЖНЫХ ГЕНЕТИЧЕСКИХ ПРИЗНАКОВ : доклад, тезисы доклада [доклад, тезисы доклада, статья из сборника материалов конференций]
    Феранчук Сергей Ильич, Шаров Вадим Витальевич, Путинцева Юлия Андреевна, Кузьмин Дмитрий Александрович, Орешкова Наталья Викторовна, Крутовский Константин Валерьевич
    2017, Сохранение лесных генетических ресурсов
    присутствует в РИНЦ (eLIBRARY.RU)
38. Программа для индексирования геномных последовательностей большого размера методом "FM-index" на графических ускорителях : регистрация программы для ЭВМ [патент]
    Шаров Вадим Витальевич, Путинцева Юлия Андреевна, Кузьмин Дмитрий Александрович
    2016
    присутствует в РИНЦ (eLIBRARY.RU)
39. STUDY OF ARMILLARIA BOREALIS PATHOGENICITY BY THE COMPARATIVE WHOLE GENOME SEQUENCING : доклад, тезисы доклада [доклад, тезисы доклада, статья из сборника материалов конференций]
    Putintseva Yu. A., Pavlov I. N., Oreshkova N. V., Sharov V. V., Kuzmin D. A., Makolov S. V., Krutovsky K. V.
    2016, The tenth international conference on bioinformatics of genome regulation and structure\systems biology
    присутствует в РИНЦ (eLIBRARY.RU)
40. SEQUENCING OF CONIFER GENOMES USING NGS : доклад, тезисы доклада [доклад, тезисы доклада, статья из сборника материалов конференций]
    Oreshkova N. V., Putintseva Yu. A., Kuzmin D. A., Sharov V. V., Biryukov V. V., Makolov S. V., Krutovsky K. V.
    2016, The tenth international conference on bioinformatics of genome regulation and structure\systems biology
    присутствует в РИНЦ (eLIBRARY.RU)
41. Разработка микросателлитных маркеров сосны кедровой сибирской (italicPinus sibirica/italic Du Tour) по результатам полногеномного italicde novo/italic секвенирования : научное издание [статья из журнала]
    Белоконь М. М., Кузьмин Д. А., Крутовский К. В., Политов Д. В., Мудрик Е. А., Полякова Т. А., Шатохина А. В., Белоконь Ю. С., Орешкова Н. В., Путинцева Ю. А., Шаров В. В.
    2016, Генетика
    присутствует в РИНЦ (eLIBRARY.RU), Ядро РИНЦ (eLIBRARY.RU), Список ВАК
42. ПАРАЛЛЕЛЬНЫЙ АЛГОРИТМ ФИЛЬТРАЦИИ ПОВТОРОВ В ДАННЫХ NGS ILLUMINA : научное издание [статья из журнала]
    Цыбин Александр Николаевич, Шаров Вадим Витальевич, Путинцева Юлия Андреевна, Феранчук Сергей Ильич, Кузьмин Дмитрий Александрович
    2016, Доклады Академии наук высшей школы Российской Федерации
    присутствует в РИНЦ (eLIBRARY.RU), Список ВАК
43. Development of Microsatellite Genetic Markers in Siberian Stone Pine (Pinus sibirica Du Tour) Based on the de novo Whole Genome Sequencing [статья из журнала]
    Belokon M. M., Politov D. V., Mudrik E. A., Polyakova T. A., Shatokhina A. V., Belokon Yu. S., Oreshkova N. V., Putintseva Yu. A., Sharov V. V., Kuzmin D. A., Krutovsky K. V.
    2016, RUSSIAN JOURNAL OF GENETICS
    присутствует в Web of Science Core Collection, Scopus
44. Программный комплекс для определения размера библиотек (insert size) парных ридов NGS Illumina : регистрация программы для ЭВМ [патент]
    Шаров Вадим Витальевич, Путинцева Юлия Андреевна, Кузьмин Дмитрий Александрович
    2015
    присутствует в РИНЦ (eLIBRARY.RU)
45. Программный комплекс по подготовке ридов NGS Illumina к ассемблированию : регистрация программы для ЭВМ [патент]
    Шаров Вадим Витальевич, Цыбин Александр Николаевич, Маколов Степан Викторович, Кузьмин Дмитрий Александрович
    2015
    присутствует в РИНЦ (eLIBRARY.RU)
46. CHALLENGES OF ASSEMBLING HUGE CONIFER GENOMES : доклад, тезисы доклада [доклад, тезисы доклада, статья из сборника материалов конференций]
    Putintseva Yu. A., Sharov V. V., Kuzmin D. A., Makolov S. V., Oreshkova N. V., Krutovsky K. V.
    2015, Plant Genetics, Genomics, Bioinformatics and Biotechnology
    присутствует в РИНЦ (eLIBRARY.RU)
47. THE WHOLE DE NOVO GENOME SEQUENCING AND ASSEMBLY OF SIBERIAN LARCH (LARIX SIBIRICA LEDEB.) AND SIBERIAN PINE (PINUS SIBIRICA DU TOUR.) : доклад, тезисы доклада [доклад, тезисы доклада, статья из сборника материалов конференций]
    Oreshkova N. V., Putintseva Yu. A., Kuzmin D. A., Sharov V. V., Biryukov V. V., Makolov S. V., Deych K. O., Ibe A. A., Shilkina E. A., Krutovsky K. V.
    2015, Plant Genetics, Genomics, Bioinformatics and Biotechnology
    присутствует в РИНЦ (eLIBRARY.RU)
48. DE NOVO SEQUENCING OF CONIFER MEGAGENOMES : доклад, тезисы доклада [доклад, тезисы доклада, статья из сборника материалов конференций]
    Krutovsky K. V., Oreshkova N. V., Putintseva Yu. A., Kuzmin D. A., Sharov V. V., Biryukov V. V., Makolov S. V., Deych K. O., Bondar E. I., Ushakova O. A., Ibe A. A., Shilkina E. A.
    2015, Plant Genetics, Genomics, Bioinformatics and Biotechnology
    присутствует в РИНЦ (eLIBRARY.RU)

Список публикаций автора сформирован в автоматическом режиме. Сообщите, если заметили неточности. Если это ваши публикации, то вы можете войти на сайт под своей учётной записью с помощью формы вверху страницу и отредактировать список публикаций самостоятельно.

Справка для редакторов сайтов и программистов об экспорте списка публикаций на сторонние сайты.