Тип публикации: патент
Год издания: 2015
Аннотация: Программный комплекс предназначен для использования в процессе подготовки геномных данных, полученных с секвенатора Illumina второго поколения, к этапу ассемблирования. Программа позволяет: производить поиск «вредных» технических последовательностей (адаптеров, праймеров, в том числе и их частей), которые могут встречаться в ридах Показать полностью(англ. reads), получаемых после секвенирования по технологии NGS Illumina; очищать и/или удалять указанные пользователем риды, если в них найдены технические последовательности; настраивать процессы поиска технических последовательностей и очистки/удаления ридов в зависимости от поставленной задачи; работать в нескольких режимах, в зависимости от типа входных данных, режим для ридов paired-end и single-end; формировать статистический отчет после выполнения поиска и очистки; обрабатывать большие массивы данных (до 400 Гб на файл); задействовать вычислительные возможности многопроцессорных архитектур.