Тип публикации: патент
Год издания: 2017
Аннотация: Программа предназначена для предварительной обработки данных секвенирования NGS Illumina. В комплексе реализован автоматизированный сценарий выполнения программ по обработке последовательностей ДНК. Для его работы используется набор программных утилит: Prinseq Lite, Trimmomatic, FastQC, Musket, AfterCleaning, CLC overlap reads. ОблПоказать полностьюасть применения - анализ геномных данных. Программа позволяет: работать с парными ридами NGS Illumina, в формате *.fastq; обрезать парные риды слева и/или справа на указанное число нуклеотидных оснований (опционально); производить очистку парных ридов от адаптеров и выполнять обрезку не качественных участков ридов; выполнять коррекцию ошибок секвенирования (которые допускаются технологией NGS Illumina); автоматически искать и при выполнении определенных условий удалять сверхпредставленные последовательности (опционально); отделять и объединять пересекающиеся парные риды в файл; формировать статистический отчет по выборке данных, которые получены в результате выполнения работы комплекса; задействовать вычислительные возможности многопроцессорных архитектур; обрабатывать большие массивы данных.