Анализ соматических мутаций в генах JAK2, CALR, MPL и ASXL1 и оценка их влияния на выживаемость пациентов с миелофиброзом : научное издание

Описание

Тип публикации: статья из журнала

Год издания: 2023

Идентификатор DOI: 10.17650/1818-8346-2023-18-1-63-75

Ключевые слова: myelofibrosis, overall survival, asxl1, Jak2, CALR, Mpl, миелофиброз, общая выживаемость

Аннотация: Введение. Развитие миелофиброза (МФ) обусловлено сложными молекулярно-генетическими событиями, которые включают драйверные соматические мутации, ответственные за конститутивную активацию JAK/STAT-сигнального пути (<i>JAK2</i>, <i>CALR</i> и <i>MPL</i>), дополнительные мутации, затрагивающие эпигенетические регуляторы (<i>TET2</i>, Показать полностью<i>ASXL1</i>, <i>IDH1/2</i> и др.) и сплайсинг РНК (<i>SRSF2</i>, <i>U2AF1</i>, <i>SF3B1</i> и др.), а также генетические аберрации, способствующие геномной нестабильности и прогрессированию заболевания.Цель исследования - проанализировать драйверные (<i>JAK2</i>, <i>CALR</i>, <i>MPL</i>) и прогностические (<i>ASXL1</i>) соматические мутации у пациентов с МФ и оценить их влияние на выживаемость.Материалы и методы. В исследование были включены 29 пациентов с МФ, отобранных врачами-гематологами Городской клинической больницы №7 и Краевой клинической больницы (Красноярск).Результаты. У 26 (89,6 %) из 29 обследованных пациентов выявлены какие-либо драйверные мутации в генах <i>JAK2</i>, <i>CALR</i>, <i>MPL</i>. Мутация p.V617F в гене <i>JAK2</i> была обнаружена у 20 (68,9 %) пациентов. Мутации в гене <i>CALR</i> выявлены у 4 (13,8 %) пациентов, в гене <i>MPL</i> - у 3 (10,3 %). У 1 из 26 пациентов присутствовали одновременно 2 драйверные мутации. Тринегативными оказались 3 (10,3 %) пациента. Соматические мутации в гене <i>ASXL1</i> выявлены методом Сэнгера у 12 (41,4 %) из 29 обследованных пациентов. Проведение таргетного секвенирования нового поколения (NGS) для 13 из 29 пациентов позволило обнаружить дополнительные генетические варианты, способствующие пониманию механизма развития и течения заболевания. При оценке общей выживаемости в группах обследуемых пациентов с диагнозом МФ, проведенной в зависимости от сочетания драйверных (<i>JAK2</i>, <i>CALR</i>, <i>MPL</i>) и прогностических (<i>ASXL1</i>) мутаций, статистически значимых различий не выявлено (p = 0,12), что, по-видимому, обусловлено небольшим размером выборки. В то же время оценка выживаемости пациентов в зависимости от <i>ASXL1</i>-статуса показала, что при наличии мутаций в гене <i>ASXL1</i> медиана выживаемости составила 45 (7-120) мес, тогда как при отсутствии мутаций - 48 (21-359) мес (р = 0,03).Заключение. Полученные результаты позволяют предположить, что присутствие мутации в гене <i>ASXL1</i> является неблагоприятным фактором течения заболевания. Background. The development of myelofibrosis (MF) is driven by complex molecular genetic events that include driver somatic mutations responsible for the constitutive activation of the JAK/STAT signaling pathway (<i>JAK2</i>, <i>CALR</i>, and <i>MPL</i>), additional mutations affecting epigenetic regulators (<i>TET2</i>, <i>ASXL1</i>, <i>IDH1/2</i>, etc.) and RNA splicing (<i>SRSF2</i>, <i>U2AF1</i>, <i>SF3B1</i>, etc.), as well as genetic aberrations that contribute to genomic instability and disease progression.Aim. To analyze driver (<i>JAK2</i>, <i>CALR</i>, <i>MPL</i>) and prognostic (<i>ASXL1</i>) somatic mutations in patients with MF and evaluate their impact on survival.Materials and methods. The study included 29 patients diagnosed with MF, selected by hematologists from the City Clinical Hospital No. 7 and Regional Clinical Hospital (Krasnoyarsk).Results. 26 (89.6 %) out of 29 examined patients had some driver mutations in <i>JAK2</i>, <i>CALR</i>, <i>MPL</i> genes. The p.V617F mutation in the <i>JAK2</i> gene was found in 20 (68.9 %) patients. Mutations in the <i>CALR</i> gene were detected in 4 (13.8 %) patients, mutations in the MPL gene were found in 3 patients (10.3 %). In 1 of 26 patients, 2 driver mutations were present simultaneously. 3 (10.3 %) patients were triple negative. Mutations in the <i>ASXL1</i> gene were detected in 12 (41.4 %) out of 29 examined patients. Conducted targeted NGS (next generation sequencing) for 13 out of 29 patients revealed additional genetic variants that contribute to the understanding of the development mechanism and disease course. When evaluating the overall survival in the groups of patients diagnosed with MF examined by us, depending on the combination of driver (<i>JAK2</i>, <i>CALR</i>, <i>MPL</i>) and prognostic (<i>ASXL1</i>) mutations, no statistically significant differences were found (p = 0.12). This appears to be due to the small sample size. At the same time, assessment of patient survival depending on <i>ASXL1</i> status showed that in the presence of mutations in the <i>ASXL1</i> gene, the median survival was 45 months (range 7-120 months), while in the absence of mutations it was 48 months (range 21-359 months) (p = 0.03).Conclusion. The results obtained allow us to assume that the presence of mutations in the <i>ASXL1</i> gene is an unfavorable factor in the course of the disease.

Ссылки на полный текст

Издание

Журнал: Онкогематология

Выпуск журнала: Т.18, 1

Номера страниц: 63-75

ISSN журнала: 18188346

Место издания: Москва

Издатель: ООО "Издательский дом "АБВ-пресс"

Персоны

  • Субботина Т.Н. (ФГБУ «Федеральный Сибирский научно-клинический центр Федерального медико-биологического агентства»)
  • Маслюкова И.Е. (ФГБУ «Федеральный Сибирский научно-клинический центр Федерального медико-биологического агентства»)
  • Семащенко К.С. (ФГАОУ ВО «Сибирский федеральный университет»)
  • Ходос Г.А. (ФГАОУ ВО «Сибирский федеральный университет»)
  • Курочкин Д.В. (ФГБУ «Федеральный Сибирский научно-клинический центр Федерального медико-биологического агентства»)
  • Шалёва А.А. (ФГБУ «Федеральный Сибирский научно-клинический центр Федерального медико-биологического агентства»)
  • Михалёв М.А. (КГБУЗ «Краевая клиническая больница»)
  • Васильев Е.В. (КГБУЗ «Краевая клиническая больница»)
  • Осадчая М.Г. (КГБУЗ «Красноярская межрайонная поликлиника №1»)
  • Дунаева Е.А. (ФБУН «Центральный научно-исследовательский институт эпидемиологии» Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека)
  • Есьман А.С. (ФБУН «Центральный научно-исследовательский институт эпидемиологии» Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека)
  • Миронов К.О. (ФБУН «Центральный научно-исследовательский институт эпидемиологии» Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека)

Вхождение в базы данных