База данных природных и трансгенных светящихся микроорганизмов: "BIOLUMBASE" : научное издание

Описание

Перевод названия: Database on Natural and Transgenic Luminous Microorganisms: "BIOLUMBASE"

Тип публикации: статья из журнала

Год издания: 2005

Ключевые слова: database, bioluminescence, natural, transgenic luminous microorganisms, база данных, биолюминесценция, природные, трансгенные светящиеся микроорганизмы

Аннотация: База данных "BiolumBase" предназначена для сбора и систематизации имеющейся в мире информации о микроорганизмах с биолюминесцентными системами и включает два раздела: "природные" и "транген-ные" светящиеся микроорганизмы. На данном этапе разработаны логические схемы разделов, проведена классификация объектов, выработаны способы преПоказать полностьюдставления характеристик, разработаны структура полей для ввода соответствующей информации, а также необходимые программные модули, в том числе компоненты взаимодействия с базой данных. Заполнение базы данных ведется на основе литературных источников и собственных экспериментальных данных; предусмотрено ее последующее открытие в сеть Интернет. Пользователи смогут получать не только каталожную информацию о штаммах, но также и информацию о свойствах и функциях известных видов светящихся бактерий, структурной организации и механизмах регуляции биолюминесцентных систем и генно-инженерных конструкций с lux-генами, их использовании, получать библиографические ссылки, делать поиск штаммов по любому набору интересующих атрибутов. База данных будет содержать информацию, которая может быть полезна в решении различных задач микробной экологии и биотехнологии, в частности, для прогноза биологической опасности использования трансгенных штаммов. Abstract-The database "BiolumBase" is designed for the selection and systematization of available world information on microorganisms containing bioluminescent systems; it includes two sections: "natural" and "transgenic" luminous microorganisms. At present, logic schemes of divisions, classification of the objects, presentation of characteristics, and the inputs of relative information, as well as the necessary program modules including links to the database, are developed. The database is constructed on the basis of published data and our own experimental results; the subsequent linkage of the database to the Internet is envisaged. Users will be able to obtain not only the catalogues of strains but also information concerning the properties and functions of the known species of luminous bacteria, the structure, regulatory mechanisms, and application of bioluminescent systems and genetically engineered constructions with lux genes, as well as to find references and to search strains by using any set of attributes. The database will provide information that is of interest for the development of microbial ecology and biotechnology, in particular, for the prediction of biological hazard from the application of transgenic strains.

Ссылки на полный текст

Издание

Журнал: Микробиология

Выпуск журнала: Т. 74, 2

Номера страниц: 278-286

ISSN журнала: 00263656

Место издания: Москва

Издатель: Федеральное государственное унитарное предприятие Академический научно-издательский, производственно-полиграфический и книгораспространительский центр Наука

Авторы

  • Медведева С.Е. (Институт биофизикги СО РАН, Красноярск)
  • Бояндин А.Н. (Институт биофизикги СО РАН, Красноярск)
  • Ланкин Ю.П. (Институт биофизикги СО РАН, Красноярск)
  • Котов Д.А. (Институт биофизикги СО РАН, Красноярск)
  • Каргатова Т.В. (Институт биофизикги СО РАН, Красноярск)
  • Родичева Э.К. (Институт биофизикги СО РАН, Красноярск)
  • Попова Л.Ю. (Институт биофизикги СО РАН, Красноярск)

Вхождение в базы данных