Особенности молекулярной упаковки 2-гидроксиимино- 1,3-дикетонов методом рентгеноструктурного анализа поликристаллов : научное издание

Описание

Тип публикации: статья из журнала

Год издания: 2022

Идентификатор DOI: 10.37952/ROI-jbc-01/22-71-9-1

Ключевые слова: dicarbonyl derivatives, oximes, 2-hydroxyimino-1,3-diketones, x-ray powder diffraction, crystal structure determination, reactivity, дикетон, оксим, 2-гидроксиимино-1,3-дикетоны, рентгеновская порошковая дифракция, определение кристаллической структуры, реакционная способность

Аннотация: В связи с изучением химической активности в реакции конденсации, методом нитрозирования соответствующих 1,3-дикетонов нитритом натрия в уксусной кислоте синтезирован и изучен ряд 2-гидроксиимино-1,3-дикетонов с различными заместителями R1 = CH3, R2 = -CH3, -C6H5, -C6H4CH3, -C6H4Cl, -C6H4Br. Предполагалось, что химическая активность этих реагентов также проявляется в предкристаллизационном состоянии в растворе через молекулярную упаковку в кристаллах. Индивидуальность полученных соединений была подтверждена C, H, N анализом, спектроскопией ЯМР и рентгеновской дифракцией. Кристаллические структуры были решены с использованием метода порошковой рентгеновской дифракции. Параметры ячейки установлены путем индексирования порошковых рентгенограмм. Пространственные группы определены из анализа систематических погасаний. Структурные решения были получены моделированием с использованием подхода «имитации отжига» в прямом пространстве. Атомы водорода включены в конечную уточняемую модель жестко связанными с соответствующими атомами C и N. Окончательное уточнение проведено методом полнопрофильного анализа. Установлено, что для исследованных соединений характерен специфический структурный мотив. Молекулярная структура построена из цепочек 2-гидроксиимино-1,3-пропандиона вокруг оси 21. Образуется спиральное чередование пропандионовых цепей, связанных в бесконечный полимер водородными связями. Соседние винтовые структуры частично пересекаются в пространстве за счет проникновения друг в друга плоских ароматических фрагментов и обеспечивают более плотную упаковку молекул. При рассмотрении вдоль оси 21 можно выделить послойное строение с характерной высотой слоя около 7.1 Å, в формировании которого 2-гидроксиимино-1,3-пропандионовый фрагмент играет доминирующую роль. Различие в химической активности соединений объясняется динамической инертностью, связанной с массой заместителя в 2-гидроксиимино-1,3-пропандионовой части молекулы. In connection with the study of chemical activity in the condensation reaction, a series of 2-hydroxyimino-1,3-diketones with various substituents R1 = CH3, R2 = -CH3, -C6H5, -C6H4CH3, -C6H4Cl, -C6H4Br. It was assumed that the chemical activity of these reagents also manifests itself in the precrystallization state in solution through molecular packing in crystals. The individuality of the obtained compounds was confirmed by C, H, N analysis, NMR spectroscopy and X-ray diffraction. The crystal structures were resolved using the X-ray powder diffraction method. The cell parameters calculated by indexing the X-ray powder diffraction patterns. The Space groups were determined from the analysis of systematic extinctions. Structural solutions were obtained by modeling using the "simulated annealing" approach in direct space. Hydrogen atoms were included in the final refined model rigidly attached to the corresponding C and N atoms. The final refinement was carried out by the full profile analysis method. It has been established that the studied compounds are characterized by a specific structural motif. The molecular structure is built of chains of 2-hydroxyimino-1,3-propandione around the 21 axis. A helical alternation of propanedione chains is formed, bound into an endless polymer by hydrogen bonds. Neighboring helical structures partially intersect in space due to the penetration of flat aromatic fragments into each other and provide a denser packing of molecules. When viewed along the 21 axis, one can distinguish a layered structure with a characteristic layer height of about 7.1 Å, in the formation of which the 2-hydroxyimino-1,3-propanedione fragment plays a dominant role. The difference in the chemical activity of the compounds is explained by the dynamic inertness associated with the mass of the substituent in the 2-hydroxyimino-1,3-propanedione part of the molecule.

Ссылки на полный текст

Издание

Журнал: Бутлеровские сообщения

Выпуск журнала: Т. 71, 9

Номера страниц: 1-10

ISSN журнала: 20740212

Место издания: Казань

Издатель: ООО "Инновационно-издательский дом "Бутлеровское наследие"

Персоны

  • Бобров Павел Сергеевич (Сибирский государственный университет науки и технологий имени академика М.Ф. Решетнева)
  • Кирик Сергей Дмитриевич (Институт химии и химической технологии СО РАН)
  • Любяшкин Алексей Викторович (Сибирский государственный университет науки и технологий имени академика М.Ф. Решетнева)
  • Субоч Георгий Анатольевич (Сибирский государственный университет науки и технологий имени академика М.Ф. Решетнева)
  • Товбис Михаил Семенович (Сибирский государственный университет науки и технологий имени академика М.Ф. Решетнева)

Вхождение в базы данных