ВОСЬМИКЛАСТЕРНАЯ СТРУКТУРА ГЕНОМОВ ХЛОРОПЛАСТОВ НАЗЕМНЫХ РАСТЕНИЙ : научное издание

Описание

Тип публикации: статья из журнала

Год издания: 2018

Аннотация: В данной работе было проверено, является ли семикластерная структура, обнаруженная у бактерий, универсальной и наблюдаются ли все обнаруженные свойства такой структуры для других геномов. Исследована внутренняя структурированность геномов хлоропластов и цианобактерий, показано, что эта структурированность существенно отличается от Показать полностьюранее обнаруженной для бактериальных геномов. Под структурированностью понимается кластеризация частотных словарей триплетов отдельных фрагментов генома, определяемых регулярным порядком, вне зависимости от функциональной роли того или иного участка. Кластеризация проводилась методом упругих карт. It is tested whether seven-cluster genome structure, detected in bacteria, is a universal one and whether all of its observed properties pertain to other genomes. Inner structuring of chloroplasts' and cyano-bacteria's genome is studied, and it is found out that this structuring notably differs from what was earlier discovered in bacterial genomes. By structuring it is meant the clasterization of triplet frequency dictionary developed for different genome fragments which have regular allocation, independent of the fragment function. The clasterization has been executed by the method of elastic maps.

Ссылки на полный текст

Издание

Журнал: Журнал общей биологии

Выпуск журнала: Т. 79, 2

Номера страниц: 124-134

ISSN журнала: 00444596

Место издания: Москва

Издатель: Наука

Авторы

  • Садовский М.Г. (Сибирский Федеральный университет Институт фундаментальной биологии и биотехнологии)
  • Сенашова М.Ю. (Институт вычислительного моделирования СО РАН)
  • Малышев А.В. (Институт вычислительного моделирования СО РАН)

Вхождение в базы данных