СТРУКТУРА ГЕНОМОВ ХЛОРОПЛАСТОВ ВОДОРОСЛЕЙ

Описание

Перевод названия: STRUCTURE OF GENOMES OF CHLOROPLAST OF SOME ALGAE

Тип публикации: статья из журнала

Год издания: 2018

Ключевые слова: тройка символов, частота, структура данных, геном, triplet, frequency, data pattern, taxonomy

Аннотация: В работе изложены результаты статистического анализа структуры геномов хлоропластов водорослей. В нашей работе в качестве структуры рассматривается расположение точек, соответствующих участкам генома, в 63-мерном пространстве частот троек символов. Геном сканируется окном длины Δ со сдвигом t. Для каждого полученного таким образом Показать полностьюучастка длины Δ вычисляется частотный словарь троек символов. Тройки символов в каждом участке рассматривались без пересечения. Было проанализировано 11 геномов хлоропластов многоклеточных водорослей и 65 геномов хлоропластов одноклеточных водорослей. Визуализация структуры каждого генома была сделана в программе VidaExpert. Для этого была построена проекция 64-мерного пространства частот в пространство первых трёх главных компонент. Исследования показали, что большинство геномов хлоропластов водорослей в пространстве первых трёх главных компонент имеют характерную структуру. Однако для геномов хлоропластов водорослей наблюдается существенно больше вариантов, отличающихся от характерной структуры, чем для геномов хлоропластов наземных растений.

Ссылки на полный текст

Издание

Журнал: Международный журнал прикладных и фундаментальных исследований

Выпуск журнала: 1

Номера страниц: 121-125

ISSN журнала: 19963955

Место издания: Пенза

Издатель: Общество с ограниченной ответственностью "Издательский Дом "Академия Естествознания"

Авторы

  • Сенашова М.Ю. (ФГБУН «Федеральный исследовательский центр «Красноярский научный центр Сибирского отделения Российской академии наук»» - обособленное подразделение «Институт вычислительного моделирования Сибирского отделения Российской академии наук»)
  • Садовский М.Г. (ФГАОУ «Сибирский федеральный университет», Институт фундаментальной биологии и биотехнологии)

Вхождение в базы данных