Тип публикации: статья из журнала
Год издания: 2024
Идентификатор DOI: 10.14258/pbssm.2024151
Ключевые слова: anemone, its, matK, nucleotide variability, transition, transversion, phylogeny, нуклеотидная изменчивость, транзиции, трансверсии, филогения
Аннотация: Впервые проведен филогенетический анализ сибирских представителей рода Anemone s. l. на основе сравнительного изучения нуклеотидного полиморфизма последовательностей участка ITS (Internal Transcribed Spacer) ядерного генома и гена matK (Maturase K) хлоропластного генома. Для анализа были использованы 54 последовательности ДНК (по 2Показать полностью7 для каждого маркера) и 8 последовательностей ДНК из GenBank. Построено 2 филогенетических дерева, каждое из которых является объединенным для методов максимального правдоподобия (ML) и байесовского вывода (Bayesian inference, BI). Топологии, полученные из двух отдельных наборов данных, в большей части согласуются друг с другом. Однако имеются отличия в местоположении отдельных видов (A. sylvestris, A. osinovskiensis). На двух построенных деревьях последовательности четко распадаются на две хорошо поддерживаемые клады: первую образуют ветреницы с основным числом хромосом х = 8, вторую - с х = 7. Полученные нами результаты согласуются с данными других авторов, разработавших систематику рода Anemone как на основе морфологических признаков, так и с использованием молекулярных маркеров. Особи одного и того же вида, произрастающие в географически удаленных частях ареала, либо не отличаются друг от друга по изучаемым последовательностям ДНК, либо имеют 1-3 точечные мутации. чThe phylogenetic analysis of Siberian representatives of genus Anemone s. l. were performed for the first time, based on a comparative study of nucleotide polymorphism of ITS (Internal Transcribed Spacer) region of the nuclear genome and matK (Maturase K) gene of the chloroplast genome. 54 DNA sequences (27 for each marker) and ;8 DNA sequences from GenBank were used for analysis. Two phylogenetic trees were built, each of which is combined for the maximum likelihood (ML) and Bayesian inference (BI) methods. Topologies derived from two separate datasets are mostly consistent with each other. However, there are differences in the location of individual species (A. sylvestris, A. osinovskiensis). On two constructed trees, the sequences clearly split into two well-supported clades: the first is formed by anemone with karyotype x = 8, the second with x = 7. Our results are consistent with the data of other authors who have developed the taxonomy of the genus Anemone both on the basis of morphological features and using molecular markers. Individuals of the same species, growing in geographically distant parts of the range, either do not differ from each other in the studied DNA sequences, or have 1-3 point mutations.
Журнал: Проблемы ботаники Южной Сибири и Монголии
Выпуск журнала: № 23-2
Номера страниц: 526-530
ISSN журнала: 23133929
Место издания: Барнаул
Издатель: Алтайский государственный университет