Тип публикации: диссертация
Год издания: 2024
Ключевые слова: молекулярная динамика, бактериальная люцифераза, осмолит, ферментативный катализ, сольватационный эффект, активный центр, динамика белка
Аннотация: Объект исследования: структура бактериальных люцифераз из родов Photobacterium leiognathi и Vibrio harveyi. Цель - определение роли структурно-динамических механизмов в эффектах осмолитов (полиолов и сахаров) на функциональные свойства бактериальной люциферазы методами молекулярной динамики. Использовали: методы теоретического молеПоказать полностьюкулярного моделирования. Изучены молекулярные механизмы, влияющие на каталитическую активность бактериальных люцифераз в средах сложного состава. Установлено: ранее неизвестное специфичное влияние осмолитов различной природы на каталитически важные элементы структуры бактериальных люцифераз; структурно-динамические различия двух гомологичных бактериальных люцифераз; связь между сохранением активности люцифераз в присутствии сахарозы и стабилизацией мобильной петли фермента. Новизна: выявлены корреляции между значениями каталитической константы фермента (бактериальной люциферазы) в средах с осмолитами и энергией взаимодействий в системе белок-вода-осмолит.