Тип публикации: статья из журнала
Год издания: 2024
Идентификатор DOI: 10.31857/S0006302924020049
Ключевые слова: GC-content, frequency dictionaries, triplets, structure, spatial distribution, GC-состав, частотные словари, триплеты, структура, пространственноераспределение
Аннотация: Рассмотрено пространственное распределение значений GC-состава фрагментов геномов хлоропластов, митохондрий и бактерий. Обнаружено, что значения GC-состава фрагментов для большинства геномов распределены не хаотически, а упорядоченно. Были обнаружены два основных типа распределения - градиентное и центрально-симметричное. У геномовПоказать полностьюхлоропластов встречается только градиентное распределение. У бактерий для GC-бедных геномов наблюдается центрально-симметричное распределение, а для GC-богатых - градиентное. У митохондрий встречаются оба варианта распределений, причем тип распределения зависит от вида организма. Distribution of values of GC-content of the fragments in spatial structure of chloroplast, mitochondrial, and bacterial genomes were explored. It was found that GC-content in the fragments for most genomes is identically but not independent distributed varaible. Two main types of distribution have been revealed: the gradient distribution and centrally symmetrical distribution. Chloroplast genomes have only a gradient distribution. In bacteria, for the GC-poor genomes, a centrally symmetrical distribution is observed, while there is a gradient distribution in the GC-rich genomes. In mitochondria, both types of distribution are present, the type of distribution depends on the type of an organism.
Журнал: Биофизика
Выпуск журнала: Т. 69, № 2
Номера страниц: 246-256
ISSN журнала: 00063029
Место издания: Москва
Издатель: ФИЦ "Пущинский научный центр биологических исследований РАН", Российская академия наук, Отделение биохимии, биофизики и химии физиологически активных соединений РАН