Тип публикации: статья из журнала
Год издания: 2023
Идентификатор DOI: 10.14258/pbssm.2023028
Ключевые слова: Analysis of genetic polymorphism of populations, atpB-rbcL, ISSR-PCR markers, phylogenetic analysis, Pulsatilla herba-somnii, Pulsatilla multifida, Pulsatilla orientali-sibirica, Pulsatilla turczaninovii, RbCl, RpoB-trnC, Анализ генетического полиморфизма популяций, филогенетический анализ, ISSR-PCR маркеры, Pulsatilla оrientali-sibirica
Аннотация: Прострелы (Pulsatilla) - род эфемероидных трав, для которых свойственно высокое морфологическое разнообразие. В ходе исследования была проведена оценка генетического полиморфизма 9 популяций, представленных видами P. orientali-sibirica Stepanov, P. turczaninovii Krylov, их гибридом P. herba-somnii Stepanov, а также P. multifida G. Показать полностьюPrizel. В результате амплификации геномной ДНК с 4 ISSR-праймерами получен 61 ампликон ДНК. Общий уровень полиморфизма - 98,36 %. Число амплифицированных фрагментов ДНК, в зависимости от праймера, варьирует от 11 (17899A) до 17 (17899B, HB12). Максимальный уровень генетической изменчивости отмечен для гибридной популяции P herba-somnii. Коэффициент пoдраздeлeннoсти изученных гопуляций (Gst) гоставляет 0,4718, что свидетельствует о высоком уровне их дифференциации. При построении дендрограммы выделяются 3 группы, каждая из которых представлена отдельным видом, при этом гибридная популяция объединяется с P. orientali-sibirica. При филогенетическом анализе изучаемых видов по хлоропластным маркерам (rbcL, rpoB-trnC, atpB-rbcL) происходит объединение P orientali-sibirica с P. multifida, а P. turczaninovii с P herba-somnii. При исследовании гибридов наиболее информативными являются ISSR, поскольку они равномерно распределены по геному и могут показать сходство с двумя родительскими организмами, тогда как хлоропласты наследуются, как правило, по материнской линии. Этим можно объяснить объединение гибрида с P. turczaninovii на филогенетических деревьях, построенных с использованием хлоропластных маркеров. Pulsatilla is a genus of ephemeroid grasses characterized by high morphological diversity. The study assessed the genetic polymorphism of 9 populations represented by the species P orientali-sibirica Stepanov, P turczaninovii Krylov and their hybrid P. herba-somnii Stepanov, and P. multifida G. Prizel. As a result of amplification of genomic DNA with 4 ISSR primers, 61 DNA amplicons were obtained. The overall level of polymorphism is 98.36 %. The number of amplified DNA fragments, depending on the primer, varies from 11 (17899A) to 17 (17899 B, HB12). The maximum level of genetic variability was noted for hybrid populations. The coefficient of genetic subdivision (Gst) of the studied populations is 0.4718, which indicates a high level of their differentiation. The dendrogram divides the studied populations into 3 groups, each of which is represented by a separate species, while the hybrid population is combined with P. orientali-sibirica. Phylogenetic analysis of the studied populations combines P orientali-sibirica with P multifida and P turczaninovii with P. herba-somnii. These data demonstrate the intermediate position of the hybrid population of P. herba-somnii. In the study of hybrids, ISSRS are the most informative, since they are evenly distributed across the genome and can show similarities with two parent organisms, whereas chloroplasts are inherited, as a rule, through the maternal line.
Журнал: Проблемы ботаники Южной Сибири и Монголии
Выпуск журнала: №22-1
Номера страниц: 146-149
ISSN журнала: 23133929
Место издания: Барнаул
Издатель: Алтайский государственный университет