Перевод названия: The Study of Microbial Communities of Salt Lakes in the Novosibirsk Region: from CFU to MAG

Тип публикации: доклад, тезисы доклада, статья из сборника материалов конференций

Год издания: 2021

Ключевые слова: communities, sequence analisys, сообщества, секвенирование

Аннотация: В результате многолетних микробиологических исследований было впервые проведено описание микробных сообществ воды, матов и донных отложений небольших соленых озер Новосибирской области. Проведено описание и сравнительный анализ микробного состава различных слоев колонки донных отложений на примере озера Соленое (модельный объект) вПоказать полностьюсоответствии с данными подробного геохимического анализа. Выделено более 500 штаммов микроорганизмов различных групп, для 260 из них проведено полногеномное секвенирование. Осуществлена филогенетическая, фенотипическая и масс-спектрометрическая характеристика штаммов. На основании данных метагеномного секвенирования проведена сборка метагеномов (сообществ озер), из которых были экстрагированы геномы (MAG) некоторых микроорганизмов. Обнаружены новые виды в доменах архей и бактерий. As a result of many years of microbiological studies, the description of the microbial communities of water, mats and bottom sediments of small salt lakes in the Novosibirsk region was carried out for the first time. A description and comparative analysis of the microbial composition of the bottom sediment columns was carried out using the example of Lake Solenoe (model object) in accordance with the data of detailed geochemical analysis. More than 500 strains of microorganisms of various groups were isolated, for 260 of them full genome sequencing was carried out. The phylogenetic, phenotypic and mass spectrometric characteristics of the strains have been carried out. Based on the metagenomic sequencing data, the metagenomes (lake communities) were assembled, from which the genomes (MAG) of some microorganisms were extracted. New species have been discovered in the Archaea and Bacteria.

Журнал: Разнообразие почв и биоты Северной и Центральной Азии

Номера страниц: 79-81

Место издания: Улан-Удэ

Издатель: Бурятский научный центр Сибирского отделения РАН

• Брянская А.В. (Курчатовский геномный центр, Институт цитологии и генетики СО РАН)
• Уварова Ю.Е. (Курчатовский геномный центр, Институт цитологии и генетики СО РАН)
• Шипова А.А. (Курчатовский геномный центр, Институт цитологии и генетики СО РАН)
• Розанов А.С. (Курчатовский геномный центр, Институт цитологии и генетики СО РАН)
• Старостин К.В. (Курчатовский геномный центр, Институт цитологии и генетики СО РАН)
• Горячковская Т.Н. (Курчатовский геномный центр, Институт цитологии и генетики СО РАН)
• Таран О.П. (Институт катализа им. Г.К. Борескова)
• Лазарева Е.В. (Институт геологии и минералогии им. В.С. Соболева)
• Пельтек С.Е. (Курчатовский геномный центр, Институт цитологии и генетики СО РАН)

• РИНЦ (eLIBRARY.RU)