Тип публикации: патент
Год издания: 2021
Аннотация: Использование: для определения пространственной структуры биологических молекул олигонуклеотидов, таких как ДНК/РНК-аптамеры. Сущность изобретения заключается в том, что осуществляют измерение малоуглового рентгеновского рассеяния от биомолекул в растворе, определение структурных параметров, измерение спектров гигантского комбинационного рассеяния, моделирование полноатомной модели пространственной структуры биомолекулы олигонуклеотида, при этом при построении полноатомной модели структуры биомолекулы олигонуклеотида используются его олигонуклеотидная последовательность, построенные на её основе наиболее вероятные вторичные структуры, отдельные уникальные для молекулы полосы спектров гигантского комбинационного рассеяния в диапазоне 600-1800 см-1, из которого извлекается и формируется набор данных о межатомных связях в молекуле, ответственных за образование элементов вторичной и третичной структур, а также прохождение валидации картины малоуглового рентгеновского рассеяния от модели на соответствие картине рассеяния от монодисперсного раствора с молекулами олигонуклеотида. Технический результат: обеспечение возможности получения пространственной структуры биологических молекул олигонуклеотидов высокого разрешения.<br> FIELD: molecular biology. <br> SUBSTANCE: invention is aimed to determine the spatial structure of biological oligonucleotide molecules, such as DNA/RNA aptamers. The essence of the invention consists in measuring small-angle X-ray scattering from biomolecules in solution, determining structural parameters, measuring giant Raman scattering spectra, modeling a full-atomic model of the spatial structure of an oligonucleotide biomolecule, while constructing a full-atomic model of the structure of an oligonucleotide biomolecule, its oligonucleotide sequence is used, the most probable secondary structures based on it, separate bands of giant Raman scattering spectra unique for the molecule in the range of 600-1800 cm-1, from which a set of data on interatomic bonds in the molecule responsible for the formation of elements of secondary and tertiary structures is extracted and formed, as well as the validation of the small-angle X-ray scattering pattern from the model for compliance with the scattering pattern from a monodisperse solution with oligonucleotide molecules. <br> EFFECT: providing the possibility of obtaining the spatial structure of biological molecules of high-resolution oligonucleotides. <br> 1 cl <br>