Тип публикации: статья из журнала
Год издания: 2021
Идентификатор DOI: 10.29296/24999490-2021-04-05
Ключевые слова: melanoma, microRNA, bening melanocytic nevi, меланома, микроРНК, доброкачественные меланоцитарные невусы
Аннотация: Введение. Меланома является онкологическим заболеванием кожи, ранняя диагностика которой крайне важна для снижения смертности. Известно, что экспрессия микроРНК в клетках меланомы и доброкачественных меланоцитарных невусов различается, это может быть применено для совершенствования ранней диагностики меланомы. Цель. Определение проПоказать полностьюфиля экспрессии микроРНК при меланоме и доброкачественных меланоцитарных новообразованиях кожи на основе микрочипирования; выявление с помощью биоинформатического анализа сигнальных путей и генов-мишеней для измененных микроРНК с целью расширения представления о патогенезе меланоцитарных новообразований кожи, а также поиска новых диагностических маркеров. Материал и методы. В исследование включены биоптаты пациентов с меланомой и доброкачественными меланоцитарными невусами. Для исследования влияния ингибитора микроРНК-4286 на экспрессию генов-мишеней выбрана человеческая культура клеток меланомы кожи BRO. Исследование экспрессионного профиля микроРНК проводилось на основе микрочипирования с последующим выполнением биоинформатического анализа. Экспрессия генов-мишеней микроРНК оценивалась на основе полимеразной цепной реакции в реальном времени. Результаты. Уровень экспрессии miR-4306 в меланоме в сравнении с меланоцитарными невусами повышался в 16,15раза, pFDR=0,036; miR-6853-3p - в меланоме в сравнении с доброкачественными меланоцитарными новообразованиями снижался в 2,11 раза, pFDR=0,036. Сигнальные пути, белки, молекулярные функции, ассоциированные с выявленными генами-мишенями данных микроРНК связаны преимущественно с пролиферацией, подвижностью, миграцией клеток. Ингибирование miR-4286 в клетках меланомы BRO приводит к снижению экспрессии ее генов-мишеней CCND1 и PLXNA2. Заключение. Можно предположить, что изменение уровней экспрессии микроРНК отражает этапы опухолевой трансформации клеток, а сама использованная нами методология профилирования микроРНК может быть применена как для лучшего понимания функциональных аспектов развития злокачественных новообразований, так и для выбора новых молекул-маркеров для диагностики злокачественных опухолей. Introduction. Early diagnostics of such oncological disease as cutaneous malignant melanoma is strictly important for the decrease of mortality. It is known that microRNA expression in melanoma cells and in bening melanocytic nevi is different, that can be used for improvement of early melanoma diagnostics. The aim of the study. The evaluation of microRNA expression profiles in melanoma and bening melanocytic nevi on the base of microarray; the identification of pathways and target genes for altered microRNA by means of bioinformatics analysis to expanse the view of the melanocytic tumors pathogenesis and to reveal new diagnostic markers. Material and methods. The study included biopsies of patients with melanoma and bening melanocytic nevi. The human melanoma cell line BRO was chosen to investigate the influence of miR-4286 inhibition on target genes expression. The microRNA expression profiles were estimated with a microarray and followed by bioinformatics analysis. MicroRNA target genes expression was assessed by real-time PCR. Results. The 16.15-fold increase of miR-4306expression level (pFDR=0,036), the 2.11-fold decrease of miR-6853-3p expression level (pFDR=0,036) were revealed in melanoma compared with bening melanocytic nevi. The pathways, proteins, and molecular functions of the detected target genes of the microRNA are associated, mostly, with cell proliferation, motility, and migration. The miR-4286 inhibition in melanoma BRO cells results in the decrease of miR-4286 target genes CCND1 and PLXNA2 expression. Conclusion. The microRNAs expression levels alteration can be supposed to associated with the stages of cell malignant transformation. MicroRNA profiling can be used both the improved comprehension of functional aspects of cancer development and the malignant tumor diagnostics.
Журнал: Молекулярная медицина
Выпуск журнала: Т. 19, № 4
Номера страниц: 27-33
ISSN журнала: 17282918
Место издания: Москва
Издатель: "Русский Врач" Издательский дом.ООО