Перевод названия: Биолюминесцентная система светящихся бактерий для анализа микробного загрязнения
Тип публикации: статья из журнала
Год издания: 2018
Идентификатор DOI: 10.17516/1997-13890060
Ключевые слова: NADH:FMN-oxidoreductase, bacterial luciferase, bacterial contamination, escherichia coli, NADH:FMN-оксидоредуктаза, бактериальная люцифераза, бактериальное загрязнение
Аннотация: Microbial contamination is usually analyzed using luciferin-luciferase system of fireflies by the detection of adenosine-5’-triphosphate (ATP). There is an opportunity to assess the bacterial contamination of various objects based on a quantitative analysis of other nucleotides. In the present study, a bioluminescent enzyme system Показать полностьюof luminous bacteria NADH:FMN-oxidoreductase (Red) and luciferase (BLuc) was investigated to understand if it can be used for quantitative measurements of bacterial cells by nicotinamide adenine dinucleotide (NADH) and flavin mononucleotide (FMN) detection. To increase the sensitivity of bioluminescent system to FMN and NADH, optimization of assay conditions was performed by varying enzymes and substrates concentrations. The lowest limits of detection were 1.2 nM FMN and 0.1 pM NADH. Escherichia coli cells were used as a model bacterial sample. FMN and NADH extraction was made by destructing cell membrane by ultrasonication. Cell suspension was added into the reaction mixture instead of FMN and NADH, and light intensity depended on number of bacterial cells in the reaction mixture. Centrifugation of sonicated sample as an additional step of sample preparation did not improve the sensitivity of method. The experimental results showed that Red and BLuc system could detect at least 800 thousand bacterial cells mL-1 by determining concentration of NADH extracted from lysed cells, while 3.9 million cells mL-1 can be detected by determining concentration of FMN. Для анализа микробного загрязнения широко используется биолюминесцентный метод, основанный на определении аденозин-5’-трифосфата (АТР) с помощью люциферинлюциферазной системы светляков. Существует принципиальная возможность оценки степени бактериальной обсемененности различных объектов исходя из количественного анализа других нуклеотидов. В работе исследована возможность применения биолюминесцентной системы светящихся бактерий NADH:FMN-оксидоредуктаза (Red) и люцифераза (BLuc) для количественного анализа бактериальных клеток путем определения количества никотинамидадениндинуклеотида (NADH) и флавинмононуклеотида (FMN) в образце. Для увеличения чувствительности биолюминесцентной системы к FMN и NADH осуществлена оптимизация условий проведения анализа путем подбора концентраций ферментов и субстратов в реакционной смеси. Максимальная чувствительность биферментной системы Red + BLuc составила 1,2 нМ FMN и 0,1 пМ NADH. Для проведения количественного анализа бактериальных клеток использовали модельный бактериальный образец - культуру Escherichia coli. Экстрагирование FMN и NADH проводили путем разрушения клеточной мембраны ультразвуковым дезинтегратором. Клеточную суспензию добавляли в реакционную смесь вместо раствора FMN или NADH, при этом интенсивность свечения биолюминесцентной системы зависела от количества бактериальных клеток в реакционной смеси. Введение в пробоподготовку дополнительной процедуры центрифугирования образца, подвергнутого ультразвуковой обработке, не привело к увеличению чувствительности метода. Таким образом, было показано, что чувствительности биферментной системы Red + BLuc достаточно для определения не менее 800 тыс бактериальных клеток в миллилитре путем экстрагирования NADH из разрушенных клеток. При анализе, основанном на определении концентрации FMN в бактериальном образце, чувствительность метода составила 3,9 млн клеток на миллилитр.
Журнал: Журнал Сибирского федерального университета. Серия: Биология
Выпуск журнала: Т. 11, № 2
Номера страниц: 174-180
ISSN журнала: 19971389
Место издания: Красноярск
Издатель: Федеральное государственное автономное образовательное учреждение высшего образования Сибирский федеральный университет