Перевод названия: Consumption of Amino Acids by Non-Cultivated Bacterioplankton of an Eutrophic Water Reservoir
Тип публикации: статья из журнала
Год издания: 2011
Ключевые слова: микроэкосистемы, Microecosystems, free-living non-cultivated bacterioplankton, amino acids, PCR-DGGE, 16S ribosomal RNA, свободноживущий некультивируемый бактериопланктон, аминокислоты, ПЦР-ДГГЭ, 16S рибосомальная РНК
Аннотация: В экспериментальных микроэкосистемах выявлены c использованием нестерильного культивирования виды (клоны) бактериопланктона водохранилища, питающиеся лизином и глицином. Структуру сообщества анализировали, применяя метод разделения амплифицированных фрагментов гена 16S рРНК бактерий в условиях денатурирующего градиентного гель-элекПоказать полностьютрофореза. Идентификация доминирующих видов (клонов) бактериопланктона проведена с использованием молекулярного клонирования и определения нуклеотидной последовательности участка гена 16S рибосомальной РНК. Обнаружено, что глицин - одна из превалирующих аминокислот эвтрофного водоема, и лизин, чье содержание в природной воде более низкое, служили питательными субстратами для разных субдоминантных видов (клонов) бактериопланктона. Таким образом, установлено, что виды свободноживущего бактериопланктона являются узкоспециализированными по потреблению отдельных аминокислот. Species (clones) of the water-reservoir bacterioplankton living on lysine and glycine were revealed in the experimental microsystems using unsterile cultivation. The structure of the community was anаlyzed using the separation of amplificated fragments of the 16S рRNA gene of the bacteria under the conditions of denаturating gradient gel electrophoresis. Identification of the dominant species (clones) of bacterioplankton was carried out using molecular cloning and determination of the nucleotide sequence of the region of 16S gene of ribosomal RNA. It was discovered that glycine, one of the prevailing amino acids of an eutrophic water reservoir, and lysine, with its lower content in natural water, served as nutrition substrates for different subdominant species (clones) of bacterioplankton. So, it was established that the species of free-living bacterioplankton are narrow-specialized with respect to the consumption of separate amino acids.
Журнал: Сибирский экологический журнал
Выпуск журнала: Т. 18, № 1
Номера страниц: 13-21
ISSN журнала: 08698619
Место издания: Новосибирск
Издатель: Федеральное государственное унитарное предприятие Издательство Сибирского отделения Российской академии наук