ГЕНОТИПИРОВАНИЕ УРАЛЬСКИХ ИЗОЛЯТОВ MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS : научное издание

Описание

Перевод названия: GENOTYPING OF ISOLATES MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS FROM URAL

Тип публикации: статья из журнала

Год издания: 2014

Ключевые слова: mycobacterium tuberculosis, генотипирование, MIRU-VNTR, сполиготипирование, Beijing, non-Beijing, genotyping, Spoligotyping

Аннотация: В работе предложена схема генотипирования возбудителя туберкулеза в Уральском ФО РФ, согласно которой на первом этапе, с использованием ПЦР в режиме реального времени, осуществляется дифференциация изолятов M. tuberculosis на группы Beijing/non-Beijing. Последующее MIRU-VNTR-типирование изолятов генотипа Beijing проводится c испольПоказать полностьюзованием 9 локусов (MIRU26, QUB26, Mtub21, Qub11b, MIRU31, MIRU40 VNTR4120, VNTR3820, VNTR3232), изолятов других генотипов (non-Beijing) – 15 локусов (Mtub04, ETRC, MIRU04, MIRU40, MIRU10, MIRU16, Mtub21, QUB11b, ETRA, Mtub30, MIRU26, MIRU31, Mtub39, QUB26, QUB4156) и/или сполиготипирования. Предложенная схема позволяет эффективно и с наименьшими затратами определять принадлежность микобактерий туберкулеза к наиболее эпидемиологически значимым генетическим группам в целях мониторинга их распространения на территории Уральского региона. The article suggests a two-step scheme of genotyping M.tuberculosis in Ural region of Russia that includes the real-time PCR for differentiation of Beijing/non-Beijing isolates as the first step and further discrimination by MIRU-VNTR-typing using a set of 9 loci (MIRU26, QUB26, Mtub21, Qub11b, MIRU31, MIRU40 VNTR4120, VNTR3820, VNTR3232) for Beijing isolates, and 15 loci (Mtub04, ETRC, MIRU04, MIRU40, MIRU10, MIRU16, Mtub21, QUB11b, ETRA, Mtub30, MIRU26, MIRU31, Mtub39, QUB26, QUB4156) and/or spoligotyping for non-Beijing isolates. The suggested scheme is an efficient and more cost- and time-effective way to identify Mycobacterium tuberculosis with most epidemiologically significant genetic groups in order to monitor its spread within Urals region.

Ссылки на полный текст

Издание

Журнал: Фундаментальные исследования

Выпуск журнала: 9-11

Номера страниц: 2485-2488

ISSN журнала: 18127339

Место издания: Пенза

Издатель: Общество с ограниченной ответственностью "Издательский Дом "Академия Естествознания"

Персоны

  • Скорняков С.Н. (Уральский научно-исследовательский институт фтизиопульмонологии Министерства здравоохранения России)
  • Умпелева Т.В. (Уральский научно-исследовательский институт фтизиопульмонологии Министерства здравоохранения России)
  • Вязовая А.А. (ФБУН НИИ эпидемиологии и микробиологии имени Пастера)
  • Кравченко М.А. (Уральский научно-исследовательский институт фтизиопульмонологии Министерства здравоохранения России)
  • Еремеева Н.И. (Уральский научно-исследовательский институт фтизиопульмонологии Министерства здравоохранения России)
  • Нарвская О.В. (ФБУН НИИ эпидемиологии и микробиологии имени Пастера)

Вхождение в базы данных