Тип публикации: статья из журнала
Год издания: 2017
Идентификатор DOI: 10.18821/0869-2084-2017-62-2-125-128
Ключевые слова: Jak2, COLD-ПЦР, аллель-специфичная ПЦР, хронические миелопролиферативные заболевания, пиросеквенирование, COLD polymerase chain reaction, Allele-specific polymerase chain reaction, chronic myelo-proliferative diseases, pyro-sequencing
Аннотация: Чувствительность методов, используемых для обнаружения соматической мутации V617F в гене JAK2, определяет возможности раннего выявления хронических миелопролиферативных опухолей (ХМО). Мутация V617F также может быть обнаружена у лиц, не имеющих развернутой картины гематологических заболеваний, и определение мутации даже в низких коПоказать полностьюнцентрациях ассоциировано с повышением риска церебрального инсульта и тромбоза артериальных и венозных сосудов. Цель данной работы заключалась в разработке методик, основанных на COLD-ПЦР и аллель-специфичной ПЦР, направленных на повышение чувствительности выявления мутации V617F, определяемой с помощью пиросеквенирования. Аналитическую чувствительность методик оценивали на контрольных образцах с различными соотношениями аллелей. Для аллель-специфичной ПЦР аналитическая чувствительность составила 0,25% мутантного аллеля при концентрации анализируемого контрольного образца 103 копий ДНК/мкл; для COLD-ПЦР - 0,5% при концентрации 104 копий ДНК/мкл. Проведена сравнительная апробация методик на клиническом материале, полученном от 106 пациентов с подозрением на ХМО. При исследовании клинических образцов методом COLD-ПЦР было обнаружено 13 (14%), а методом аллель-специфичной ПЦР - 15 (16%) положительных образцов. Во всех 15 случаях обнаружения мутации было получено клиническое подтверждение диагноза ХМО. Предложенные методики позволяют увеличить эффективность амплификации мутантной ДНК в исследуемых образцах и тем самым повысить чувствительность последующего анализа продуктов амплификации методом пиросеквенирования, что позволяет рекомендовать использование методик для подтверждения диагноза ХМО и раннего выявления лиц с повышенным риском развития венозных и артериальных тромбозов. The possibilities of early detection of chronic myelo-proliferative tumors (MPT) are determined by sensitivity of techniques implemented for finding somatic mutation V617F in gene JAK2. The mutation V617F can also be found in individuals without unfolded picture of hematological diseases. The detection of mutation even in low concentrations is associated with increasing of risk of cerebral stroke and thrombosis of arterial and venous vessels. The study was carried out to develop techniques based on COLD polymerase chain reaction and allele-specific polymerase chain reaction targeted to increasing of sensitivity of finding mutation V617F detected using pyro-sequencing. The analytical sensitivity of techniques was evaluated by control samples with different ratio of alleles. For allele-specific polymerase chain reaction analytical sensitivity amounted to 0.25% of mutant allele at concentration of analyzed control sample 103 copies of DNA per mkl. For COLD polymerase chain reaction sensitivity amounted to 0.5% at concentration 104 copies of DNA per mkl. The comparative approbation of techniques was implemented using clinical material obtained from 106 patients with suspicion on MPT. The analysis of clinical samples using COLD polymerase chain reaction revealed 13 (14%) and using technique of allele-specific polymerase chain reaction - 15 (16%) positive samples. In all 15 cases of detection of mutation clinical confirmations of diagnosis of MPT was received. The proposed techniques permit increasing efficiency of amplification of mutant DNA in analyzed samples and hence to increase sensitivity of subsequent analysis ofproducts of amplification using technique of pyro-sequencing. Therefore, the mentioned techniques can be recommended to be applied for confirmation of diagnosis of MPT and early identification of individuals with increased risk of development of venous and arterial thromboses.
Журнал: Клиническая лабораторная диагностика
Выпуск журнала: Т. 62, № 2
Номера страниц: 125-128
ISSN журнала: 08692084
Место издания: Москва
Издатель: Открытое акционерное общество Издательство Медицина