РАЗРАБОТКА НОВЫХ МАРКЕРОВ МИТОХОНДРИАЛЬНОЙ ДНК СОСНЫ ОБЫКНОВЕННОЙ (Pinus sylvestris L.) ДЛЯ ПОПУЛЯЦИОННО-ГЕНЕТИЧЕСКИХ И ФИЛОГЕОГРАФИЧЕСКИХ ИССЛЕДОВАНИЙ : научное издание

Описание

Тип публикации: статья из журнала

Год издания: 2015

Идентификатор DOI: 10.7868/S0016675815120103

Аннотация: В выборке деревьев сосны обыкновенной (Pinus sylvestris L.) европейского, сибирского, монгольского и кавказского происхождения с целью разработки маркеров митохондриальной ДНК (мтДНК) были ресеквенированы участки геномной ДНК, имеющие гомологию с контигами мтДНК ели европейской (Picea abies (L.) Karst.) и сосны ладанной (Pinus taedПоказать полностьюa L.). Также были исследованы и ресеквенированы фланкирующие некодирующие области некоторых митохондриальных генов. Было выявлено пять однонуклеотидных замен (SNP) и один фрагмент, содержащий минисателлитный локус. Кавказские образцы отличались от остальных по трем SNP. Два SNP были сцеплены с маркером в первом интроне гена nad7 и суммарно с ним позволили выявить три гаплотипа в европейских популяциях. В сибирских и монгольских популяциях изменчивых SNP не выявлено. Минисателлитный локус содержал 41 аллель в европейских, сибирских и монгольских популяциях, но, вероятно, в силу высокой скорости мутирования обнаруживал слабую дифференциацию популяций (FST = 0.058).

Ссылки на полный текст

Издание

Журнал: Генетика

Выпуск журнала: Т. 51, 12

Номера страниц: 1386

ISSN журнала: 00166758

Место издания: Москва

Издатель: Федеральное государственное унитарное предприятие Академический научно-издательский, производственно-полиграфический и книгораспространительский центр Наука

Персоны

  • Семериков В.Л. (Институт экологии растений и животных Уральского отделения Российской академии наук, Екатеринбург 620144)
  • Путинцева Ю.А. (Научно-образовательный центр геномных исследований Сибирского федерального университета, Красноярск 660036)
  • Орешкова Н.В. (Научно-образовательный центр геномных исследований Сибирского федерального университета, Красноярск 660036)
  • Семерикова С.А. (Институт экологии растений и животных Уральского отделения Российской академии наук, Екатеринбург 620144)
  • Крутовский К.В. (Научно-образовательный центр геномных исследований Сибирского федерального университета, Красноярск 660036)

Вхождение в базы данных